Serija prepričava izniman život Leonarda da Vincija kroz djela koja su ga proslavila, te kroz priče skrivene u tim djelima, postupno otkrivajući unutrašnje muke čovjeka opsjednutog dostizanjem savršenstva. Producenti otvoreno priznaju da su se namjerno odmaknuli od povijesne stvarnosti i ubacili elemente fantazije, kao što je priča o optužbama za ubojstvo u koje su navodno bili upleteni Leonardo i lik Caterine da Cremona.