Agent tajne službe Ethan Burke odlazi u ruralni gradić kako bi pronašao dva nestala federalna agenta. Ethan je bio logičan odabir za tu misiju. On je jedan od najboljih agenata tajne službe iz ureda u Seattleu. A također je i osoba koja je poznavala agenticu Kate Hewson bolje od ikoga. Bili su partneri. Bili su i više od toga. Njihov je odnos gotovo razorio Ethanov brak. Sada su Kate i njezin partner iz tajne službe nestali s lica zemlje. Čim je Ethan ugledao ploču s natpisom "Dobro došli u Wayward Pines, mjesto gdje raj postaje dom!,” kamion udari u njegov automobil. Kad se Ethan probudi u bolnici gradića Wayward Pines, uz njegov krevet sjedi napeta i nepredvidljiva sestra Pam. No kako će se uskoro pokazati, čini se da je Pam više zainteresirana da nekomu naudi nego da ga izliječi. Ona i Ethan postaju smrtni neprijatelji, a ispostavi se da je njezina uloga u gradiću Wayward Pines dublja negoli je itko shvaćao. U bolnici se Ethan prisjeti svog imena, adrese u Seattleu i prometne nesreće koja se dogodila na periferiji gradića. Zna da je agent tajne službe i da je došao u Wayward Pines kako bi istražio nestanak dvaju agenata. Ono što ne može shvatiti jest što ne valja u ovom sablasno savršenom gradiću. Nijedan telefon ne radi niti se može javiti svojoj supruzi i šefu u tajnoj službi. Njegov novčanik, dokumenti, telefon… Sve je nestalo, a nitko mu ne želi pomoći. Kako se misteriji u gradiću počinju gomilati i ne slažu se s njegovim shvaćanjem nedavnih događaja, Ethan počinje propitkivati svoje mentalno zdravlje. Suočava se s misterioznim i karizmatičnim Dr. Jenkinsom, psihijatrom koji ga liječi u bolnici Wayward Pinesa. Jenkins je uvjeren da je Ethan doživio oštećenje mozga u prometnoj nesreći te da je to uzrok njegove paranoje. Sumnjajući u svoju dijagnozu, Ethan vjeruje da dr. Jenkins nije onakav kakvim se prikazuje. Kako počinje upoznavati neke od lokalnih stanovnika, među njima i izrađivača igračaka Harolda Ballingera, Ethan se sprijatelji s Beverly, konobaricom koja ne bira riječi i koja je o pitanju Wayward Pinesa oprezna kao i on. Kod kuće u Seattleu Ethanova supruga i bivša agentica tajne službe Theresa Burke primi poziv od Ethanova šefa Adama Hasslera iz tajne službe. Ethan je nestao. Nisu dostupne nikakve informacije dok prve istrage ne pokažu da Ethan nije bio u autu koji su pronašli uz cestu u blizini Wayward Pinesa. Istraga i dalje traje. To nije dovoljno za Theresu. Sa svojim sinom tinejdžerom Benom Theresa započinje svoju potragu za Ethanom. 2. sezona U glavnim ulogama druge sezone su: glumac s dvostrukom nominacijom za nagradu Oscar - Djimon Hounsou (Krvavi dijamant, San o Americi),glumica s nominacijama za nagrade Emmy i Zlatni globus - Hope Davis (American Crime, Uredništvo) i Jason Patric (Groznica, Narko). U novoj sezoni uzbudljivih događaja i preokreta neće nedostajati. Stanovnici malenog gradića Wayward Pines i dalje će se boriti protiv autoritarne vladavine Prve generacije. Dr. Theo Yedlin (Jason Patric), novi stanovnik Wayward Pinesa, pokušat će pomoći ugroženoj ljudskoj vrsti, ali i shvatiti što se zapravo događa u Wayward Pinesu. Drugoj sezoni pridružit će se poznata glumačka imena poput: Nimrat Kaur (Domovina) koja će utjeloviti Rebeccu, ženu punu tajni koje skriva pred svojim suprugom Theom, Josh Helman (Pobješnjeli Max: Divlja cesta, X-Men: Dani buduće prošlosti) kao samopouzdan i lukav mladić Xander i Kacey Rohl (Hannibal) kao Kerry, jedna od pripadnika Prve generacije. Uz to, neki od glumaca iz prve sezone pojavit će se i u drugoj sezoni. Među njima se nalazi i poznati hollywoodski glumac Terrence Howard (Empire) koji će i dalje glumiti lik strogog šerifa Arnolda Popea, a Carla Gugino nastupa kao Kate Hewson - nestala agentica koju Ethan pokušava pronaći.