Hvaljen od strane fanova i kritike zbog svog avantgardnog pristupa animaciji i znanstveno fantastičnom pripovijedanju, »Aeon Flux« donosi futurističku priču o lijepoj i neustrašivoj ubojici i njezinom ponekad neprijatelju, a ponekad ljubavniku Trevoru Goodchildu. Svaka epizoda ima zasebnu radnju, a povezuje ih tajna misija koju Aeon treba ostvariti.
Aeon Flux je neustrašiva i ne čeka da vidi tko ili što vreba iza ugla, ona odmah kreće u akciju! Laka na oružju, i bez obzira na posljedice, kada joj neko stvorenje stane na put odmah ga liši života, ali s puno stila. Iako je Aeon često suočena s preranom smrti tijekom svojih misija, uspjeva se izvući i nastavlja živjeti u srcima zagriženih fanova ... i na MTV-ju!