Radnje smještene 1940-ih u Punjabu, QISSA potanko opisuje posljedice Indopakistanske podjele kroz iskustva jedne obitelji Sikha, kojoj je na čelu Umber (Irrfan Khan). Nakon nasilnog preseljenja njegove obitelji iz njihova sela, Umberova žudnja za muškim nasljednikom jača je nego ikada.
Kad mu njegova žena rodi četvrtu kćer Kanwar, Umber donese kobnu odluku da je odgoji kao dječaka. Ova nesretna odluka završi podjelom obitelji na buran način te uzrokovanjem niza izrazito uznemirujućih situacija za Kanwar tijekom njezina odrastanja.