Napoleon Dynamite (Heder) je školski izopćenik u pravom smislu te riječi. On provodi cijelo vrijeme sam, igrajući se s loptom ili crtajući slike njegove omiljene životinje. Ni kod kuće mu stvari nisu puno bolje, njegov stariji brat Kip (Ruell) i umišljeni ujak Rico (Gries) su zauzeti s vlastitim planovima da bi obratili pažnju na Napoleona. Tek s dolaskom novog učenika Pedra (Ramirez) Napoleon otkriva prijateljstvo. Naime Pedro se odluči kandidirati za školskog predsjednika i Napoleon će učiniti sve kako bi mu pomagao. U ovu priču se uskoro upleće i Deb, djevojka za koju Napoleon nesto osjeća ali ne zna kako bi joj to pokazao.